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薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的联合通信作

归档日期:05-14       文本归类:三色椒草      文章编辑:爱尚语录

  金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),车前科众年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常睹的盆栽、切花及天井欣赏的园艺花草,正在古罗马时期就已竣事了驯化。正在过去的三十年中,金鱼草向来行为分子和发育遗传学的形式作物,许众闭节基因是正在金鱼草中被初度呈现,蕴涵MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、支配花瓣外皮细胞样子的MYB基因MIXTA、花色基因ROSEA、VENOSA以及支配自交不亲和的SLFs(S-Loucs F-box)等。金鱼草中内正在生动的转座子促使了基因的分袂和剖判。可是,迄今为止,这些斟酌都是正在贫乏基因组序列条款下实行的,无法斟酌这些基因、转座子和性状的全部进化和遗传机闭。

  指日,中邦科学院遗传与发育生物学斟酌所薛勇彪斟酌组拉拢梁承志斟酌组、John Innes核心Enrico Coen斟酌组和华大基因等斟酌团队,诈欺第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序本事,联结遗传图谱辅助拼装战术,竣事了对栽培金鱼草(Antirrhinum majus cv. JI7)的全基因组序列测定。

  该斟酌获得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,笼罩度为97.12%,说明了37714个卵白编码基因,通知了一个近乎完善的金鱼草基因组。通过对序列的较量剖判显示,车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其比来的先人处分裂并正在大约四千六百万到四千九百万年前发作了全基因组复制变乱,该全基因组复制对金鱼草中与花过错称性联系的TCP基因家族进化具有要紧进献。另外,该斟酌呈现金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在大约2Mb的序列上含有102个基因,个中包括37个SLF基因但缺失S-RNase,提示该花柱因子的损失是栽培金鱼草得回自交亲和性状的要紧原故,并呈现栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性。综上,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化斟酌。

  该斟酌结果于1月29日正在线宣告正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)。薛勇彪斟酌组李苗苗、张冬芬、张辉,梁承志斟酌组高强、马斌,中科院北京基因组斟酌所骆迎峰和华大基因陈春海为论文的配合第一作家,薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的配合通信作家。该斟酌获得中科院策略先导项目、邦度科技部及邦度自然科学基金委的经费撑持。

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